穆棱经济开发区的快速发展和林木产业的集聚，林木产业已成为园区的主导产业，中俄边境最大林木产业集群已初具雏形，成为哈-牡-绥-东经济带上的一大亮点。为了更好的服务于穆棱市林木产业发展，对外展示穆棱市林木产业优势，扩大知名度，打造林木产业品牌，穆棱市委、市政府决在定开发区内建设一座集自然生态、产业状况、产品展示于一体的林木博物馆。
该馆是穆棱市打造中俄边境最大林木产业集群所投资建设的集自然生态、环境保护、标本收藏、科普教育、观赏娱乐、爱国主义教育为一体的具有国际先进水平、国内一流的高标准林木专业博物馆。建设远东林木博物馆是穆棱市落实牡丹江市建设“沿边开放先导区”和“地板之都”要求，打造中俄边境最大林木产业集群的一项重要举措。
2008年1月成立博物馆筹备处，组织人员到外地进行了考察，借鉴经验，同时组织人员进行了展品征集和施工企业的招标。到各林场收集了大量的有关林业产业的展品。同时，到北京等地进行考察，选定国内知名的北京一彩空间有限公司承建方。并邀请了东北林业大学的专家对博物馆的建设进行现场指导和论证。
2008年8月20日建设完工并正式开放。